memo-x

Berita, komentar, dan fitur terbaru dari The Memo X

Colacanth yang aneh belum pernah 65 juta tahun tidak berubah sama sekali, mengungkapkan genomnya

Pada tahun 1938, sisa-sisa hidup, yang diyakini telah punah 65 juta tahun yang lalu, secara tidak sengaja ditangkap di jaring ikan di lepas pantai Afrika Selatan.

Panjangnya 2 meter (6,5 kaki) Colacanth (Latimeria ChalomniDia adalah salah satu kerabat terdekat ikan – dan sebagian besar tetap tidak berubah sejak kemunculan terakhirnya dalam catatan fosil yang berasal dari masa selain burung. Dinosaurus.

Bukti genetik baru sekarang menunjukkan bahwa predator laut dalam ini telah mengalami evolusi yang samar namun tersebar luas pada tingkat genetik – dengan membajak gen dari spesies lain.

Saat mencari basis data genetik untuk versi leluhur dari gen manusia yang terlibat dalam regulasi gen, ahli genetika molekuler Isaac Yellan di Universitas Toronto secara tak terduga menemukan bahwa Colacanth mengandung banyak variasi dari gen tersebut.

Yang lebih mengejutkan, variasi yang berbeda dari gen CGGBP ini tidak semuanya memiliki nenek moyang yang sama satu sama lain. Ini menunjukkan bahwa di beberapa titik sekitar 10 juta tahun yang lalu, 62 dari gen ini diturunkan oleh coelacanth dari spesies lain yang tidak terkait – melalui Transfer gen horizontal.

Gen-gen ini, dengan kemampuannya untuk “melompat” di sekitar genom dan bahkan di antara genom, sampai batas tertentu Virus, Dikenal sebagai Transposon.

Jika mereka melompat ke tempat yang tepat dalam genom, mesin seluler akan menyalinnya seperti gen lainnya. Tetapi mereka juga bisa melompat ke tempat yang salah, di mana mereka bisa berbahaya dan dengan demikian dianggap sebagai parasit.

Kadang-kadang, mereka dapat berakhir pada posisi yang menguntungkan bagi spesies inangnya dan akhirnya kehilangan kemampuan lompatan mereka tetapi dikonservasi di lokasi baru mereka dalam genom, yang tampaknya telah terjadi di Colacanth beberapa kali. .

READ  Penemuan dinosaurus predator terbesar di Eropa di Isle of Wight

“Transfer gen horizontal mengaburkan gambaran dari mana transposon berasal, tetapi kami tahu dari spesies lain bahwa hal itu dapat terjadi karena parasitisme,” Dia berkata Yilan. “Penjelasan yang paling mungkin adalah bahwa ini telah dikembangkan berkali-kali sepanjang sejarah evolusi.”

Meskipun transposon seperti ini biasa ditemukan di banyak spesies, bukan hal yang aneh menemukan banyak.

Percobaan tabung reaksi dan pemodelan komputer menunjukkan setidaknya delapan protein yang dikodekan gen ini untuk menghubungkan ke urutan berulang DNA yang berbeda, menunjukkan bahwa mereka – seperti versi manusia – terlibat dalam regulasi gen. Beberapa di antaranya hanya diekspresikan di jaringan tertentu.

“Kami tidak tahu apa yang 62 gen ini lakukan, tetapi banyak di antaranya menyandikan protein pengikat DNA dan mungkin berperan dalam regulasi gen, di mana bahkan perubahan kecil pun penting dalam evolusi.” menjelaskan Ahli genetika molekuler dari Universitas Toronto, Tim Hughes.

Coelacanth memiliki sirip berlekuk seperti kaki yang lebih dekat hubungannya dengan kita dan kerabat ikan terdekat kita, lungfish, daripada jenis ikan lainnya. Nenek moyang kita yang sangat jauh berarti bahwa genom Colacanth berpotensi membantu kita mengungkap banyak misteri tentang evolusi kita.

Sayangnya, ikan ini jarang terlihat dan terancam punah, sehingga kesempatan untuk mempelajarinya terbatas. Tetapi informasi yang kami dapatkan dari mereka benar-benar terbukti bermanfaat.

Sebuah Penelitian baru-baru ini Gen mereka menunjukkan bahwa reseptor pahit kita mungkin memiliki peran yang melampaui melindungi kita dari zat beracun, seperti mengatur metabolisme dan merasakan hormon. Sekarang gen colacanth telah menunjukkan bahwa transposon memainkan peran yang lebih besar daripada yang kita sadari dalam evolusi tetrapoda.

“Temuan kami memberikan contoh yang cukup nyata dari fenomena transposon yang berkontribusi pada genom inang,” Dia berkata Hoge.

READ  Ledakan kehidupan di Bumi terkait dengan aksi logam berat di pusat planet | telah berevolusi

Penelitian ini dipublikasikan di Biologi Molekuler dan Evolusi.